Коломенская духовная семинария реализует Образовательные программы уровня бакалавриата по направлениям: 48.03.01 "Теология" и "Подготовка священнослужителей и религиозного персонала религиозных организаций".
Подготовка священнослужителей по образовательным программам уровня бакалавриата осуществляется в соответствии с разработанными Учебным комитетом Русской Православной Церкви документами, касающимися введения единого учебного плана в духовных образовательных учреждениях Русской Православной Церкви.
Разработка образовательных программ, направленных на подготовку священнослужителей и религиозного персонала религиозных организаций, проводится в соответствии с существующей в Русской Православной Церкви традицией духовного образования, получившей отражение в «Концепции высшего духовного образования Русской Православной Церкви», «Церковном образовательном стандарте высшего духовного образования специалиста в области православного богословия», «Концепции дальнейшего реформирования системы духовного образования Русской Православной Церкви».
Подготовка по направлению "Теология" осуществляется в соответствии с Федеральным государственным образовательным стандартом 48.03.01 Теология (уровень бакалавриат).